檢視不同波長影響光合作用速率的原始碼

<font size="6">不同波長影響光合作用速率</font>
<s4e>
pid=194
show=原始設計者;簡介
</s4e>
<div style="float:left;">
<font color="red" size="5">觀察植物葉片在不同光源下的的光合作用效率，了解光的波長對光合速率的影響。
<br></font><br>

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</div>

<div style="float: right; border:black 1px solid;">
<font color="blue">實驗材料: </font>
:*植物葉片 數片
:*打洞器(吸管)	數支
:*0.2% 小蘇打水	100 mL
:*100c.c 塑膠杯	3個/組
:*10ml 注射筒	1個/組
:*燈泡（白、藍、紅光）	1套/組






</div>

==1.現象說明： ==

植物行光合作用以製造養分，光合作用速率因光合色素對各色光有著不同的吸收程度而有影響。

</table>
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<img style="height:300px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/34/%E7%A8%BB%E7%B1%B3%E7%A8%AE%E9%A1%9E.png/800px-%E7%A8%BB%E7%B1%B3%E7%A8%AE%E9%A1%9E.png'/>
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==2.探究問題：（此為引導，學習者必須要提出合理的假說） ==

*2.1	觀察「萃取DNA膠圖」後標示組別與樣本種類，並寫出從膠圖中看到什麼結果？
*2.2	標示NanoDrop測量結果，並分析你所抽取的DNA品質如何。
*2.3	觀察「PCR膠圖」後標示組別，並寫出從膠圖中看到什麼結果？
*2.4	查查看，池上米？越光米？台秈OO號？台農OO號？桃園OO號？壽司米？台灣米的名字種類很多，為什麼這樣命名？是依據什麼做的分類？
*2.5	想想看，若將延長(extension)的溫度下調至36℃，會不會影響實驗結果？為什麼？


 
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==3.實作項目 ==

*1.萃取DNA
:*1.	取10粒米切取胚芽部分放入研缽。
加BashingBead buffer 750 ul研磨。(打破細胞)
:*2.	移入BashingBead tube。
加Proteinase K 1 ul。(分解蛋白質)<br>
65 ℃ 水浴 10 min。<br>
10,000 rpm 離心 1 min。(移除雜質)
:*3.	取上清液500 ul加入III-F filter+ collection tube。<br>
8,000 rpm 離心 1 min。(過濾雜質)
:*4.	移除III-F filter。
:*5.	在collection tube中，加入Lysis buffer 1500 ul。(打開DNA＋準備Binding)<br>
和過濾液充分混合。
:*6.	取混合液 800 ul。(DNA Binding在膜上)<br>
加入II-C column+ collection tube。<br>
10,000 rpm 離心 1 min。
:*7.	倒掉濾液。<br>
重複step 6兩次。
:*8.	把II-C column移至新的collection tube。<br>
加入Pre-wash buffer 200 ul。(去除糖類、蛋白質)<br>
10,000 rpm 離心 1 min。
:*9.	倒掉濾液。<br>
加入Wash buffer 500 ul。(去除糖類、蛋白質)<br>
10,000 rpm 離心 1 min。
:*10.	把II-C column移至新的eppendorf。
加入Elution buffer 20 ul。(回溶DNA)<br>
10,000 rpm 離心 30 sec。
:*11.	取HRC-filter+ collection tube。<br>
加入Prep solution 600 ul。<br>
8,000 rpm 離心 3 min。
:*12.	把HRC-filter移至新的eppendorf。(去除酚類)<br>
加入剛剛Elute的DNA 20 ul。<br>
15,000 rpm 離心 3 min。
:*13.	標上組別， -20 ℃保存。

:*14.	測DNA濃度(NanoDrop)

:*15.	跑2%電泳


*跑PCR
:*1.	PCR 試劑配置-四要素<br>
<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f1/PCR%E8%A9%A6%E5%8A%91.png/800px-PCR%E8%A9%A6%E5%8A%91.png'/>
<br>Taq polymerase最適合的extension溫度是72℃

*2.	PCR 試劑配置<br>
<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/ca/Pcr%E8%A9%A6%E5%8A%91%E9%85%8D%E7%BD%AE.png/800px-Pcr%E8%A9%A6%E5%8A%91%E9%85%8D%E7%BD%AE.png'/>

*3.	PCR 條件
<br>
<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/cd/Pcr%E6%A2%9D%E4%BB%B6.png/800px-Pcr%E6%A2%9D%E4%BB%B6.png'/>

<br>
<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/1/1f/PCR%E6%BA%AB%E5%BA%A6.png'/>

*4.	電泳跑膠
<br>
<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/aa/%E9%9B%BB%E6%B3%B3%E8%86%A0.png/800px-%E9%9B%BB%E6%B3%B3%E8%86%A0.png'/>






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==4.分析與結論 ==

*4.1 從萃取DNA膠圖中判斷是否有抽出DNA。
*4.2 從PCR膠圖中判斷樣本是BAD2基因是否正常，並判斷是否與預期結果相同。
*4.3 若PCR膠圖有585bp和355bp兩條bands，則代表此為純品系一般米DNA；若膠圖中有577bp和257bp兩條bands，則為純品系香米DNA；若同時具有585bp、355bp和257bp，則為異型合子的一般米。




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==5.教學目標與評量 ==

*5.1	了解香米具有香氣的原因是由於BAD2的缺損。
*5.2	能熟悉DNA萃取的操作方式。
*5.3	能從Nano drop的結果判斷DNA品質好壞。
*5.4	熟悉PCR和電泳的操作方式。
*5.5	能從PCR膠圖判斷樣品的種類。





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==6.參考資料： ==
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==7.參考說明： ==
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*萃取DNA膠圖<br>
<img style="height:350px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/6a/%E8%90%83%E5%8F%96DNA%E8%86%A0%E5%9C%96.png'/>
*PCR膠圖
<img style="height:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/72/PCR%E8%86%A0%E5%9C%96.png/800px-PCR%E8%86%A0%E5%9C%96.png'/>