"PCR檢測植物病毒感染" 修訂間的差異

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:*PCR machine 1/台
 
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==1.現象說明： ==
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稻米的分類：
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病毒顆粒為絲狀彎曲 ( Transmission electron micrographs)。PVX 感染茄科植物其病徵表現主要為系統性，感染藜科（Chenopodiaceae）或莧科（Amaranthaceae）後會造成局部性病斑（local lesions），也會感染部分豆科植物（Leguminosae）。
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2.依米質(胚乳)的特性
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*茉莉香米 Jasmine rice
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:*1. 屬於秈稻，具茉莉花香
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:*2. 香味原因：基因 BAD2 失去功能，造成 2AP 累積
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:*3. 香味源自揮發物 2-acetyl-1-pyrroline (2AP)
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:*4. 2AP 由脯氨酸 proline 和鳥氨酸ornithine代謝而成的衍生物
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<img style="width:150px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/f/fc/%E6%B3%B0%E5%9C%8B%E9%A6%99%E7%B1%B3.jpg'/>
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<img style="width:200px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/70/%E6%B3%B0%E5%9C%8B%E9%A6%99%E7%B1%B32.jpg'/>
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*香米為何而香？<br>
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  泰國科學家近日宣布，他們已經分析獲得了泰國香米基因圖譜中的『致香』環節，並且已經在美國專利與商標局申請了專利。由此，泰國准備人工改良其他普通大米，使之也具有香米的獨特芳香。<br>
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  泰國大米基因項目負責人阿皮差·旺納威吉29日在曼谷表示，自去年底泰國國家基因工程中心和泰國農業大學攜手繪制出泰國茉莉花香米的基因圖譜後，科學家們一直在研究圖譜中的『致香』環節。這一難點的突破有助於農產品的改良。<br>
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  泰國國家基因工程中心主任馬拉格·探提差龍說，為了研究泰國茉莉花香米，研究人員花費了數月時間終於在其基因圖譜中找到了引發這種香米散發出獨特茉莉花香的基因部分。他說，通過類比移植的方法可以使其他品種的大米也散發出香米的氣味。<br>
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  馬拉格說，研究發現，香米之所以香，其實是因為發生了基因突變。通俗說來，香米實際上包含有非正常基因。以泰國茉莉花香米為例，在它的基因圖譜中，有8個基因處於『停工』狀態。也就是說，這8個形同擺設的基因正是引發這種大米散發出茉莉花香的最主要原因。<br>
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  大米基因組由約5000個基因組成。泰國科學家說，他們目前正在研究，是否可以將其他大米基因組中相同位置的8個基因『人工破壞』，使其處於『停工』狀態，從而達到改普通米為香米的目的。<br>
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  馬拉格說，這一發現對於泰國農業具有相當重要的意義。通過相同的方法，一些普通品種的玉米、稻谷、小麥、豆子和椰子都可以得到人工改良，從而提高質量和產量。(來源：新華社)<br>
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<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d0/BAD2%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%95%B0%E5%B8%B8.png/748px-BAD2%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%95%B0%E5%B8%B8.png'/><br>
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<img style="width:500px;" src='https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a0/BAD2%E6%AA%A2%E6%B8%AC.png/799px-BAD2%E6%AA%A2%E6%B8%AC.png'/><br>
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==2.探究問題：（此為引導，學習者必須要提出合理的假說） ==
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*2.1 觀察「萃取DNA膠圖」後標示組別與樣本種類，並寫出從膠圖中看到什麼結果？
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*2.2 標示NanoDrop測量結果，並分析你所抽取的DNA品質如何。
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*2.3 觀察「PCR膠圖」後標示組別，並寫出從膠圖中看到什麼結果？
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*2.4 查查看，池上米？越光米？台秈OO號？台農OO號？桃園OO號？壽司米？台灣米的名字種類很多，為什麼這樣命名？是依據什麼做的分類？
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*2.5 想想看，若將延長(extension)的溫度下調至36℃，會不會影響實驗結果？為什麼？
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於 2020年10月2日 (五) 17:19 的修訂

PCR檢測植物病毒感染

原始設計者：彰師大

觀察植物在特定病毒感染後病徵，並利用PCR技術檢測植物是否有被病毒感染。



實驗材料:

  • 葉片 數片
  • 1.5 ml 離心管 3/個
  • 廢液杯 1/個
  • 離心機 1/個
  • tip 1/個
  • Rank 1/個
  • 電子秤 1/個
  • 打洞器 1/個
  • 微量離心管 1/個
  • Master mix(Taq, buffer, dNTP, dye) 10/µL
  • TE buffer 100/ml
  • Primer F’ 4/µL
  • Primer R’ 4/µL
  • ddH2O 1/µL
  • PCR machine 1/台
  • 電泳槽 1/台

1.現象說明：

稻米的分類：

1. 病毒顆粒為絲狀彎曲 ( Transmission electron micrographs)。PVX 感染茄科植物其病徵表現主要為系統性，感染藜科（Chenopodiaceae）或莧科（Amaranthaceae）後會造成局部性病斑（local lesions），也會感染部分豆科植物（Leguminosae）。

　


2.依米質(胚乳)的特性

  • 茉莉香米 Jasmine rice
  • 1. 屬於秈稻，具茉莉花香
  • 2. 香味原因：基因 BAD2 失去功能，造成 2AP 累積
  • 3. 香味源自揮發物 2-acetyl-1-pyrroline (2AP)
  • 4. 2AP 由脯氨酸 proline 和鳥氨酸ornithine代謝而成的衍生物



  • 香米為何而香？
 泰國科學家近日宣布，他們已經分析獲得了泰國香米基因圖譜中的『致香』環節，並且已經在美國專利與商標局申請了專利。由此，泰國准備人工改良其他普通大米，使之也具有香米的獨特芳香。

 泰國大米基因項目負責人阿皮差·旺納威吉29日在曼谷表示，自去年底泰國國家基因工程中心和泰國農業大學攜手繪制出泰國茉莉花香米的基因圖譜後，科學家們一直在研究圖譜中的『致香』環節。這一難點的突破有助於農產品的改良。

 泰國國家基因工程中心主任馬拉格·探提差龍說，為了研究泰國茉莉花香米，研究人員花費了數月時間終於在其基因圖譜中找到了引發這種香米散發出獨特茉莉花香的基因部分。他說，通過類比移植的方法可以使其他品種的大米也散發出香米的氣味。

 馬拉格說，研究發現，香米之所以香，其實是因為發生了基因突變。通俗說來，香米實際上包含有非正常基因。以泰國茉莉花香米為例，在它的基因圖譜中，有8個基因處於『停工』狀態。也就是說，這8個形同擺設的基因正是引發這種大米散發出茉莉花香的最主要原因。

 大米基因組由約5000個基因組成。泰國科學家說，他們目前正在研究，是否可以將其他大米基因組中相同位置的8個基因『人工破壞』，使其處於『停工』狀態，從而達到改普通米為香米的目的。

 馬拉格說，這一發現對於泰國農業具有相當重要的意義。通過相同的方法，一些普通品種的玉米、稻谷、小麥、豆子和椰子都可以得到人工改良，從而提高質量和產量。(來源：新華社)





2.探究問題：（此為引導，學習者必須要提出合理的假說）

  • 2.1 觀察「萃取DNA膠圖」後標示組別與樣本種類，並寫出從膠圖中看到什麼結果？
  • 2.2 標示NanoDrop測量結果，並分析你所抽取的DNA品質如何。
  • 2.3 觀察「PCR膠圖」後標示組別，並寫出從膠圖中看到什麼結果？
  • 2.4 查查看，池上米？越光米？台秈OO號？台農OO號？桃園OO號？壽司米？台灣米的名字種類很多，為什麼這樣命名？是依據什麼做的分類？
  • 2.5 想想看，若將延長(extension)的溫度下調至36℃，會不會影響實驗結果？為什麼？




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